Đội trẻ

Morimoto được đào tạo ở câu lạc bộ Tsudayama năm 1995, trước khi chuyển đến Verdy Junior năm 1998. Sau 3 năm, Morimoto bắt đầu thi đấu cho Đội trẻ Verdy Junior năm 2001, và ở lại đây cho đến năm 2004 khi anh được bán cho Tokyo Verdy 1969.

FC Tokyo Verdy

Ngày 13 tháng 3 năm 2004, Morimoto có trận đấu đầu tiên tại J. League khi vào sân trong trận đấu giữa Tokyo Verdy 1969 và Júbilo Iwata khi mới 15 tuổi, 10 tháng, 6 ngày để trở thành cầu thủ trẻ nhất ra sân tại J. League.[2] Anh ghi bàn thắng đầu tiên vào ngày 5 tháng 5 cùng năm vào lưới JEF United Ichihara, hai ngày trước sinh nhật lần thứ 16, giúp anh nắm giữ thêm kỷ lục là cầu thủ trẻ nhất ghi bàn tại J.League.[3] Anh đoạt danh hiệu Cầu thủ trẻ xuất sắc nhất J. League mùa giải 2004.[4] Ngày 23 tháng 7 năm 2006, Tokyo Verdy 1969 thông báo đã thỏa thuận với Calcio Catania cho Morimoto đến Serie A thi đấu theo bản hợp đồng cho mượn có thời hạn 1 năm.[5]

Calcio Catania

Morimoto có trận đấu đầu tiên tại Serie A vào ngày 28 tháng 1 năm 2007 trong trận đấu với Atalanta.[6] Anh vào sân ở phút 83 và ghi bàn gỡ hòa chỉ 5 phút sau đó.[7] Bàn thắng đầu tiên này cho Catania của Morimoto được đánh giá cỡ 1 triệu euro (tức 135 triệu Yên) ở Nhật Bản theo dự báo của 47% trong tổng số 70 chuyên gia kinh tế và quảng cáo được hỏi trong một cuộc nghiên cứu thị trường vì bàn thắng ở Serie A của Morimoto rất có ý nghĩa trong lĩnh vực truyền thông và hình ảnh. Ngày 13 tháng 3 năm 2007, Morimoto mắc phải chấn thương dây chằng ở chân trái và khiến anh phải nghỉ thi đấu 6 tháng, tức là toàn bộ giai đoạn còn lại của mùa giải 2006–07.[2] Mặc dù Morimoto gặp phải chấn thương nghiêm trọng như vậy, Catania vẫn quyết định ký hợp đồng chính thức với anh vào tháng 6 năm 2007

Ngày 14 tháng 12 năm 2008, Morimoto gia hạn hợp đồng hợp đồng với Catania thêm ba năm, đến 2011.[8] Ngày 21 tháng 12, tại vòng 17 Serie A, anh lập được cú đúp trong chiến thắng 3-2 trước AS Roma[9] và được Goal.com bầu chọn vào đội hình tiêu biểu của vòng đấu.[10]

Mùa giải 2008–09, Morimoto ghi được 10 bàn thắng trong 25 trận thi đấu cũng như có nhiều đường chuền thành bàn. Tiền đạo người Brasil Alexandre Pato đã nói với báo Corriere Dello Sport rằng anh đánh giá Morimoto là cầu thủ trẻ xuất sắc nhất tại Serie A và so sánh Morimoto với Ronaldo.[11] Tuy nhiên đến mùa giải 2010-11, Morimoto chỉ ghi được một bàn thắng do không thể cạnh tranh nổi vị trí chính thức trong đội hình.

Novara Calcio

Ngày 11 tháng 7 năm 2011, Catania chính thức xác nhận đã bán Morimoto cho câu lạc bộ vừa thăng hạng Serie A Novara theo một hợp đồng chia sẻ quyền sở hữu.[12] Chấn thương đã khiến Morimoto chỉ ra sân được 18 lần và ghi được 4 bàn. Cuối mùa giải 2011-12, Novara xuống hạng Serie B còn Morimoto trở về Catania ngày 21 tháng 6 năm 2012.

Ngày 7 tháng 1 năm 2013, Morimoto được đem cho câu lạc bộ Al Nasr, được dẫn dắt bởi cựu huấn luyện viên Catania là Walter Zenga, mượn cho đến ngày 30 tháng 6 năm 2013.

JEF United

Ngày 14 tháng 8 năm 2013, Morimoto đã ký hợp đồng với JEF United Chiba tại Giải bóng đá Hạng nhì Nhật Bản, với phí chuyển nhượng không được tiết lộ.[13]